*Importance de tenir à jour nos connaissances sur notre haplogroupe

Lorsque vous recevez vos résultats de tests d’ADN-Y  sur 12, 25, 37 ou 111 marqueurs, la compagnie Family Tree DNA  FTDNA vous informe de l’haplogroupe auquel votre ADN-Y devrait appartient selon leur prédiction.  Cet haplogroupe est uniquement estimé ou prédit à partir des valeurs des marqueurs STR de votre signature.

Il n’a pas été vérifié ou déterminé en examinant le polymorphisme d’état des SNP dans votre ADN-Y.

Pour visualiser la position de ce haplogroupe dans la taxonomie courante utilisée par FTDNA, il faut aller dans votre page personnelle et cliquer sur « Haplotree & SNPs » dans le bloc réservé à l’ADN-Y.  Une fenêtre s’ouvrira avec la classification courante pour votre haplogroupe. Une flèche à la hauteur du SNP pour lequel votre ADN-Y aura été estimé positif pointera l’haplogroupe auquel devrait appartenir votre ADN-Y.

La Figure suivante présente une partie de la page qui apparaît lorsque l’haplogroupe prédit est R-M269 qui est  l’haplogroupe le plus fréquemment rencontré chez les Français et leurs descendants de la diaspora.

R-M269 est la façon courte de représenter l’haplogroupe majeur R au niveau du noeud qui correspond au SNP appelé M269.

R-M269 est en notation courte. La notation longue aussi appelée ‘nodale’ (composée de noeuds numérotés)  pour ce haplogroupe est  R1b1a1a2  dans la classification courante (2017-jul-10) de l’ISOGG, [https://isogg.org/tree/ISOGG_HapgrpR.html] et R1b3b1a pour FTDNA.

Étant donné que les noeuds d’une classification sont régulièrement renumérotés à cause de la découverte de nouveaux SNP ou suite à l’abandon de certains,  mieux vaut s’en tenir à la notation courte qui elle ne change pas.

Comme on peut le voir sur la Figure, le SNP M269 ne se situe pas complètement à l’entrée de la branche de l’haplogroupe R.

SNP-order

Figure 1.

L’objectif de cette page Haplotree à FTDNA est de permettre de voir o\u se situe votre haplogroupe dans leur classification, et de vous inciter à faire déterminer l’haplogroupe d’appartenance de votre ADN-Y en achetant de nouveaux tests.

Les tests portent sur des SNP qui sont connus comme faisant partie de la taxonomie régionale de l’haplogroupe prédit pour votre ADN-Y.

Les SNP de couleur doré sont présumés possédés par votre ADN-Y. Dans le présent exemple,  le M343 et le M269 sont estimés présents.

Il y a deux approches pour tester pour la présence de nouveaux SNP. La première est de procéder par essai et erreur, un SNP à la fois. C’est une approche qui peut coûter très cher.

La seconde est de commander une batterie de SNP qui vont aider à cerner l’haplogroupe de votre ADN-Y.  Cette batterie s’appelle un SNP Pack.

Dans le présent exemple, FTDNA propose à son client de commander le SNP Pack R1b-M343 (xM269) qui comprend 154 SNP.

Le R1b – M343(xM269) SNP Pack couvre les SNP suivants qui sont sur l’haplotree à ce jour du 2017-jul-10.

L754, P297, M269, M73, M478, V88, PF6310, PF6289, F3867, L389, PF4354, M335, FGC20980, PH155, PH200, F2482, SK2056, Y13208, Y22195, Y22196, Y20747, Y20784, Y20770, Y20756, Y20758, Y20750, Y20752, Y20763, Y20760, Y14051, Y14160, Y14061, Y14191, L1432, FGC21003, FGC21055, FGC20986, FGC21038, FGC21039, FGC21007, FGC20998, FGC21011, FGC20971, FGC21034, FGC20970, FGC21010, FGC21056, FGC21015, FGC21017, FGC21060, FGC21053, FGC21008, FGC21062, FGC21065, FGC21047, FGC21049, FGC21023, SK2065, V3181, Y18865, Y18462, Y18871, Y18459, Y24712, FGC39712, Y21723, FGC39717, FGC39694, FGC39699, FGC39725, FGC39700, Y8443, Y7788, SK2071, Y8438, Y7771, BY14376, V1636, V2313, CTS5330, CTS6189, CTS7124, CTS1647, BY15590, BY15608, BY15620, V69, BY17657, BY17660, BY17661, BY17659, BY17658

Et, à titre exploratoire, le SNP Pack inclut les SNP suivants qui ne sont pas sur l’Haplotree à ce jour:

M18, BY15361, BY15371, B301, B302, BY14576, BY14579, BY17637, BY17638, BY17640, BY17641, BY17642, BY17643, BY17644, BY17645, BY17646, BY17647, BY17648, BY17649, BY17650, BY17651, BY17652, BY17653, BY17654, BY17655, BY17656, BY19083, BY19084, CTS8612, FGC20964, FGC38304, FGC39691, PF6316, PF6319, PF6328, PF6359, PF7548, PH1578, PH4504, SK2057, SK2066, SK2067, SK2072, SK2081, V1169, V1314, V2687, V35, V7, V8, Y17712, Y21722, Z30280, Z30284, Z30290, Z30297, Z30317, Z30349, Z30351, Z30353, Z30360, V1487

La compagnie FTDNA va donc sonder votre ADN-Y pour la présence ou non de tous ces SNP et à partir de la liste ordonnée phylogénétiquement des SNP pour lesquels votre ADN-Y apparaîtra dérivé (ou positif), classera votre ADN-Y à l’endroit approprié dans sa taxonomie.

Si votre ADN-Y s’avère dérivé pour un SNP qui n’est pas encore intégré à sa taxonomie, il est possible que cette découverte permette à FTDNA de faire croître sa taxonomie.  En effet, une taxonomie est une représentation hypothétique, un modèle représentatif, de l’ordre phylogénétique dans lequel des mutations SNP se sont produites, conduisant des lignées d’hommes à se différencier les unes des autres formant des haplogroupes lorsqu’elles partagent ou dérivent d’un ancêtre commun. Une taxonomie est comme un buisson ou un corail en constante croissance.

Se faire tester contribue donc à la science, à la confirmation et au développement de connaissances à propos de l’ADN-Y.

Mais attention! il est possible que ce SNP Pack R1b-M343 (xM269) ne fasse que confirmer que votre ADN-Y est R-M269. En effet, in ne vérifiera pas dans votre ADN-Y la présence de SNP dérivés plus en aval que le SNP M269.

En effet, tous les SNP testés se trouvent en amont de M269, et incluant M269. Aucun SNP plus en aval de M269 n’est testé. Or la grande majorité des hommes dont l’ADN-Y est estimé R-M269 par FTDNA sont positifs pour des SNP plus en aval de M269.

Il faudra alors commander un SNP Pack au spectre plus large comme le SNP Pack R1b – M343&M269v2 Backbone.

 

Celui-ci examine les SNP suivants dans la taxonomie à FTDNA:

M343, L754, L278, P25, P297, M269, L478, PF6404, L23, L51, L11, L151, P310, P311, P312, L21, Z290, DF21, DF25, M222, Z255, Z253, L513, CTS4466, Z195, U152, L2, Z49, Z367, Z192, Z36, Z225, DF19, U106, L48, L47, U198, Z156, Z18, M73, V88, PF6289, L226, L238, DF99, Z8, Z326, A223, FGC4077, FGC4133, FGC8739, S588, DF85, L389, DF27, DF63, DF96, DF49, Z2185, Z16433, ZZ7_1, Z16434, Z16437, DF41, FGC5494, PF7562, S1026, S1051, Z198, Z209, Z2103, Z251, FGC3861, S5982, S5668, S6365, S764, S691, L1065, Z3000, A431, ZZ19_1, ZZ12_1, BY2285, Z34609, FGC20747, FGC20764, L555, DF98, A259, L459, Z4161, CTS12684, Z260, Z245, FGC5780, Z2105, S3058, Z43, PH155, V1636, FGC31923, FGC31929, FGC31939, BY16680, BY16696, BY16690, A15809, BY16692, A15808, BY16698, BY16699, A15807, A11710, A11711, A11712, Y31466, Y31467, Y31468, FGC42003, FGC42006, FGC42011, Z29766, Z29764, Z29758, BY1713, PF6535, Y410, PF6414, L388, CTS9416, PF7575, M12149

 

et ceux-ci non encore présents:

CTS5330, FGC3861, GG445, GG460, PH2558, M697, PF7559, PF7560, PF7564, PF7566, PF7568, PF7572, PF7573, PH4238, Z29765, Z29767, Z29782, Z29799, Z29802, Z29784, BY18740

L’objectif est de connaître la position qu’occupe notre ADN-Y dans la classification. Or cette position taxonomique peut être plus ou moins profonde ou avancée sur notre branche d’hommes.

Nous vous encourageons donc dans un premier temps à faire déterminer l’haplogroupe et le sousclade de votre ADN-Y et dans un second temps à contribuer à la recherche dans le domaine en tenant à jour les connaissances à propos du sousclade de votre ADN ou de celui de votre famille.

La Généalogie Génétique ancestrale peut progresser grâce aux résultats obtenus par des personnes comme vous qui font tester leur ADN pour satisfaire une curiosité insatiable à propos de leurs origines et de celles des autres humains. En vous tenant à jour au sujet des possibilités de test de votre ADN, vous fournissez à la communauté des généalogistes la possibilité d’identifier de nouvelles feuilles à l’arborescence des haplogroupes humains.
Les sous-groupes qui sont ainsi identifiés seront éventuellement mis en perspective ou en relation avec des faits archéologiques documentés, avec l’existence passée ou présente de populations et de dialectes, avec d’autres faits biologiques (comme les types sanguins), ainsi qu’avec des évènements historiques connus, incluant des migrations et des invasions.
Les sous-groupes découverts pourraient même conduire à une révision de l’histoire des populations, comme c’est le cas pour la Grande Bretagne, pour l’Islande, et peut-être pour l’Europe entière. Vos résultats constituent en effet le matériau de base à partir duquel les connaissances sur l’humanité croissent.

Par surcroît, en participant à des projets cladistiques ou patronymiques, les résultats de vos tests deviennent immédiatement disponibles à toute la communauté des chercheurs et ainsi contribuent à faire croître rapidement les connaissances dans le domaine.
Merci de vous engager dans un processus de testing régulier qui vous permettra de vous tenir à la fine pointe des connaissances sur vos origines, et ce faisant, de contribuer à l’avancement des connaissances dans le domaine fascinant qu’est la généalogie génétique ancestrale.